康樂及文化事務署署長是康樂及文化事務署財政預算的管制人員，負責管理和交代轄下各項開支。署長必須確保部門以符合經濟效益的方式提供高效率及優質的服務。

本署的日常工作開支由政府一般收入帳目撥付。在二零零六至零七財政年度，本署從上述帳目的總目95康樂及文化事務署項下獲撥款50.27億元，用以支付康樂及體育、園藝及市容設施、文物及博物館、表演藝術和公共圖書館等範疇的運作和非經常開支。本署亦負責向香港拯溺總會、香港考古學會、本地體育團體及非政府機構營舍提供資助金，協助該等機構支付其運作開支。

本署為香港海底隧道附近的隧道入口處休憩花園提供園藝保養服務。

本署的主要系統及設備項下超過200萬元的個別項目，以及電腦化計劃的費用，均由政府的基本工程儲備基金撥款支付。二零零六至零七年度的主要項目包括數碼圖書館系統（1.44億元）及新的圖書館電腦系統（1.96億元）。

本署籌劃進行的基本工程計劃也是由基本工程儲備基金撥款支付。工程的撥款及進度，則由建築署負責監管。

本署設有一套財政預算管制系統，確保妥善監察部門的開支，使其不超逾核准預算。本署透過超過150名財政管制人員，分三層架構，實施財務管理及預算管制。各級管理人員雖獲授權調配資源，但他們必須負責實施預算管制，並交代其轄下每項開支。

康樂及文化事務署署長負責管理超過700項收費，並確保不時檢討各項收費，以及迅速而妥善地把這些來自收費方面的收入入帳。

在二零零六至零七年度，本署經修訂的收入預算總額為7.95億元。收入主要來自文康活動的入場費、文康設施的租用費和租金收入。有關款額會記入政府一般收入帳目內。